一、办公室

负责党建、纪检监察、退休职工管理工作；负责办文办会、公务接待、资产管理、后勤保障工作；负责制度建设、档案保密、信息化建设、宣传教育、考核督办、信访维稳、综治普法、文明创建工作；办理上级交办和领导安排的其他工作。

二、计划财务科

负责预决算收支、审核、报表等财务管理工作；负责采购管理、经济统计工作； 负责人事劳资;指导和监管环保公司、千斤园村、市木材厂财务工作；办理上级交办和领导安排的其他工作。

三、湿地管理科

负责三峡库区湿地相关工作；负责天然林保护、退耕还林工作；办理上级交办和领导安排的其他工作。

四、规划建设科

负责编制区域规划和专项规划；负责基础设施建设和维护工作；办理上级交办和领导安排的其他工作。

五、资源保护科（社区管理科）

负责自然资源综合管理、林政执法、旅游资源管理工作；

承担森林防火、防灾减灾、禁毒、安全生产工作；负责全市国有林场、森林公园相关工作；负责社区发展和管理服务工作；办理上级交办和领导安排的其他工作。

六、项目管理科

负责保护区勘界立标、生态搬迁、原居民生产生活设施和建设项目审核等相关工作；负责环保督察整改工作；负责三峡后续项目相关工作；办理上级交办和领导安排的其他工作。

七、产业发展科

负责监管环保公司和市木材厂；负责虾子沟码头征收拆迁工作；办理上级交办和领导安排的其他工作。

八、移民管理办公室

负责移民后续扶持、对口支援、结对援建、移民培训和信访维稳等工作；办理上级交办和领导安排的其他工作。

九、科研监测科（野生蔬菜研究所）

负责生物多样性、生态环境、森林病虫害、疫源疫病监测；负责科技综合管理、科技交流与合作；负责野生蔬菜资源调查研究和推广应用；办理上级交办和领导安排的其他工作。

十、新宫管理站、千斤园管理站、五指山管理站

负责辖区范围内自然资源、林政执法、旅游资源、原居民生产生活设施和建设项目监管工作；承担辖区范围内森林防火、防灾减灾、禁毒、安全生产工作；办理上级交办和领导安排的其他工作。